的边民有三千余人，马援安排他们返回原来居住的县邑。
同时，马援上奏朝廷，为这些县邑派遣县长、官吏，修缮城郭，建起小城堡，开挖沟渠，鼓励耕作、放牧。
此后，金城的百姓安居乐业。马援又采用和亲政策让塞外的羌人部落归降。
之后，马援还上疏朝廷，恢复了氐人的侯、王、君长各种封号，并由朝廷赐给印绶。
建武十三年，武都郡参狼羌部落与塞外羌人部落叛乱，马援率军四千前往镇压。
马援军占据有利地形，夺取羌人的水草地，采用困而不战的方法击败羌人，迫使羌人数十万户出逃塞外。
羌人部落投降马援者有一万余人，于是陇西恢复了平静。
马援在治理陇西期间广施恩信，善待属下，按能力任命官吏，自己就只总揽大局。
马援将琐碎的行政事务安排给各级官员管理、处置，自己只管豪族大姓侵犯小民，奸猾的官吏徇私枉法之事。
在马援任太守期间，当地被治理得局势安定，没有出现羌人反叛的事情。
马援在担任陇西太守六年后，被皇帝召回京师，拜为虎贲中郎将。
当初，马援任陇西太守时，曾谏言皇帝重新铸造五铢钱。此事因三府认为不宜施行便被搁置。
马援回京任职后，针对奏章上十余条疑问逐一解释，再次上书阐述理由。
终于在建武十六年，刘秀采纳马援的建议，下诏重新铸造五铢钱，新钱得以流通，百姓都从这一措施的施行中获益。
起初，卷县人维汜自称神仙，有弟子数百人，都因此而获罪被杀。
后来，维汜的弟子李广又聚集党徒，于建武十七年，攻下晥城，杀死晥侯刘闵，自称南岳大师。
皇帝派遣谒者张宗率军数千人前往讨伐，被李广打败。
九月，皇帝派马援攻打李广获胜，斩杀李广及其党徒。
交阯郡女子征侧与妹妹征贰于建武十六年造反，攻打郡城。
九真郡、日南郡、合浦郡的蛮夷起兵响应，占领了六十五座城池，征侧自立为王。
朝廷便命令长沙、合浦、交阯等郡做好备战工作。
建武十七年，刘秀拜马援为