了。因为大明王朝对准噶尔汗国进行封锁，让噶尔丹很少能够得到补给，眼看就撑不住了。
渐渐的，策妄阿拉布坦占了上风，噶尔丹的部下开始成批的投降策妄阿拉布坦。而噶尔丹的部下也纷纷向明投诚，包括他的侄子丹津鄂木布和杜噶尔阿拉布坦。
此时的噶尔丹已经成了孤家寡人，手下兵马不足三千，军官不足百人。
公元1660年，明军兆惠得到确切消息，和策妄阿拉布坦两路出兵夹击噶尔丹，消灭了其部下大部分人马。
当兆惠擒获噶尔丹的时候，他身边除了女儿钟济海，就只剩阿拉尔拜、格隆诺颜两位军官及不到百人。
此时的一代枭雄噶尔丹已经是穷途末路，形同孤家寡人。
终于这场策妄阿拉布坦与噶尔丹之间的恩怨情仇，关于准噶尔权力、利益与家族仇恨交织的残酷斗争，画上了句号。
抓到了噶尔丹，朱由检并没有让兆惠押往京城，而是命令在当地斩首示众，号令天山南北，震慑诸国。