北部的吉贝屿、镇海屿，并在镇海屿修筑城堡，以作为南下出击澎湖岛的军事基地。这次中、荷的军事冲突严重地影响海上贸易的正常运行，郑芝龙受李旦之命，以翻译的身份抵达澎湖岛，虽然李旦并不给荷兰人提供武装支援，但他与荷兰人仍要保持海上贸易的合作。郑芝龙的任务很可能是对台海战局进行军事评估，有时他也率船队袭击掠夺贸易竞争对手的船只，特别是与西班牙贸易往来的船只，荷兰人与李旦同样仇视西班牙人。
五月，南居益加强了进攻的力量，准备先攻打荷兰人的船队，再攻打澎湖岛上的堡垒，进而困死荷兰人。郑芝龙可能就是在五月前后撤离了澎湖岛，返回到平户，他可能已经判断荷兰人必败无疑。到了七月，中国军队已是必胜之局，荷兰人选择了投降，拆除了岛上的军事设施，退出澎湖，后来转移到了台湾岛的南部。
郑芝龙在李旦的海商集团中崛起，这是他事业的开端，但对他影响最大的人，并非是李旦，而是平户的另一位华人英雄颜思齐。
颜思齐的老家是漳州海澄，是当时中国惟一开放港月港的所在地。在明代中期，漳州人入海为盗的数量很庞大，因此这里民风剽悍，不乏好勇斗狠的亡命之徒。颜思齐也是习武出身，后来被官宦人家所辱，一怒之下打死官宦家的仆人，闹出人命，闯了大祸。幸好这里是中国最繁忙的海港，每天都有船驶向大洋，颜思齐躲在船仓之中，经过辗转到了日本的平户，避开了仇家与官府的追杀。
到日本后，颜思齐最初以裁缝为业，后来也投入海上贸易的暴利行业之中，经过数年的积累，他也成为平户有名的富翁。颜思齐与李旦是平户华人海商中最著名的两个，但两人的志趣并不尽相同，李旦是纯粹的商人，而颜思齐则象是传说中的梁山泊英雄一样，有着远大的政治抱负。他几乎也是以英雄人物的行动规范来要求自己，仗义疏财、性情豪爽，这使他在平户华人世界中赢得了尊重，无论是商人还是海盗，都对他敬佩有嘉，甚至他也赢得了日本当地政府的重视，被任命为甲螺。
但这点成就对颜思齐来说，简直是微不足道，他雄心勃勃，想建立一块中国人的海外殖民地。海上贸易的暴利虽然十分诱人，但是日本始终是中国政府明文规定的出口禁运国，在中国政府眼中，这帮暗