，郑鸿逵对他颇为心疼，称他为\"吾家之千里驹”，在郑芝龙意图降清时，也是郑鸿逵暗中嘱咐郑成功秘密率一支军队离开安平前往金门，这样郑成功才得以避免同父亲一同前往清营而惨遭扣押的命运。
在郑成功安平起兵后，又是郑鸿逵援助他一起攻打泉州城，到了潮州之后，两人携手开拓潮阳、揭阳根据地，这些时间的合作里，郑鸿逵与郑成功之间从来未产生任何矛盾，郑成功对他这位叔父也非常尊重，在他率军南下勤王之际，还请求郑鸿逵北上厦门岛协防，可见他对叔父没有任何防备之心，相当信任。
这次郑鸿逵私下放走马得功的清军，与郑成功之间开始产生矛盾，致使郑成功怀疑他与清军有秘密往来。
郑成功的怀疑并非没有道理。
在那个年代，今天是南明将领，明天成为清军将领的情况，实在是太多太多，这也是南明政权屡战屡败的原因。这里还有另一个原因引起郑成功的怀疑，那就是侵犯厦门岛的马得功曾经是郑鸿逵的部将，那是在弘光政权的时候，当时郑鸿逵守卫采石矶，以右军都督挂镇海将军印，马得功是标下守备，所以两人不仅相识，而是有过比较密切的关系。
郑成功身上武士的荣誉感以及国破家亡所带来的强烈的复仇感，使他从一开始就是最坚定的抗清斗士，无论时局如何危恶，无论处境如何困难，甚至连父亲作为人质落入清军之手，都无法改变他浴血坚持的决心，所以他绝对无法容忍叔父郑鸿逵有降清的倾向。
郑鸿逵心知隔阂已经产生，而他在此事上也确实犯下不可饶恕的错误。他决心以行动来证明自己的清白，他命令军队撤出中左所城，移驻白沙，这个地方离南安石井十里，离安平三十里。同时给郑成功写了一封信：“马虏在于清，重以母命故耳。不然，我亦何意何心也？侄有疑吾之言，不亦错乎？”
郑鸿逵部撤出中左所后，郑成功才率舰队入厦门港，在澳仔港扎营，并且召集高级将领讨论厦门失守的功罪。
在厦门的抗击清军入侵的将领中，以施郎功劳最大，虽然他是以休假的名义返回厦门，手上并没有军队，但仍然凭借数十人的力量，对清军展开反攻，因而成为厦门之役中表现最好的将领，郑成功赏赐给施郎纹银二百两。但施郎坚决不受