有些不好意思，因为自认为功勋不够显赫，所以他想在瓜州一战中，显露他的本领。
郑成功听了之后很高兴，便命令马信率军在潭家洲附近的浅滩登陆，然后从陆地发起进攻，而张煌言、陈文达则率水师的铳船，也就是炮船，在长江江面上炮击潭家洲的清军炮台，以掩护马信兵团的强攻。在张煌言等人的炮船向潭家洲一阵猛击之后，马信辖下的将士奋勇冲镇，从三面进攻炮台。当时潭家洲炮台有清兵五百人，数十门大炮，拒不投降，郑军冒着清军的猛烈炮火，顽强逼近，勇不可挡。这场战斗在六月十五日打响，仅一天的功夫，马信兵团便夺取潭家洲炮台，全歼守军。
攻陷潭家洲炮台之后，左武卫镇指挥官周全斌率舟师逆流而进，这一天恰是天气晴朗，刮起东南风，对周全斌的舰队非常有利，顺风而进，直抵清军所设下的第二道防御线，即横江铁索链，这绰号为滚江龙的横江铁索并没有难住郑军，周全斌命令精通水性的四十余人泅水而下，砍断铁索，舰队得以扬帆直进，进逼瓜州城。
周全斌率全镇士兵登陆后，列队前进，直扑瓜州城。操江军门朱衣佐得悉潭家洲炮台被攻陷，而横江铁索也被郑军所破坏，心中大惊，忙与游击左云龙率满汉清军数千人马，出城迎战。此时郑军的大部队也陆续抵达，周全斌全镇上下，更是士气如虹，一鼓而进，清军前锋被斩杀数十人，朱衣佐一看，后面还有郑军主力源源不断地赶来呢，不行，好汉不吃眼前亏，赶紧把旗一挥，撤回瓜州城内。
此时马信在夺取潭家洲炮台后，绕到瓜州城后，也向该城发起进攻。此时韩英所率的正兵镇、杨祖所率的左先锋镇也都杀到城下，这韩英、杨祖两人，哪肯落在马信、周全斌之后呢？两人命令架起云梯，亲自操起藤牌，身先士卒，自己先登城了。主将都操刀上阵了，士兵们哪里敢落在后面，于是四面八面的登城部队便蚂蚁一样一拥而上。
驻守瓜州城的清军江协同知徐腾鲸看到郑军这个进攻架式，早吓得六神无主，魂飞魄散了，他一溜烟，自个先弃城而逃了。朱衣佐一看，徐腾鲸溜走了，四面八方都是郑军，不行也得逃，他与副将左云龙两人一商量，就想逃到扬州去吧。主将走的走，逃的逃，剩下来的士兵有几个真心想抵抗，这分寸大乱，被郑军一拥而上，