眉头紧锁，显然内心正在激烈斗争。父子二人再次陷入僵持，气氛剑拔弩张。
几天后，朱标带着一封密信和几件证物再次来到御书房。他将信件呈上，那信件仿佛带着千钧之力。朱元璋看完，脸色铁青，猛地将信件拍在桌上，震得茶杯都跳了起来。朱标看着朱元璋的反应，心中涌起一阵畅快。他挺直了脊梁，周围那些曾经小看他、暗中与藩王勾结的大臣们，此刻都面露惊恐之色，朱标一一扫视过去，目光如剑，仿佛在无声地宣告着自己的胜利。朱标心中一块大石终于落地，他知道自己赌对了。周围的太监宫女吓得瑟瑟发抖，大气都不敢出。
朱标看着暴怒的朱元璋平静地开口：“父皇……”
“父皇息怒，惩治奸佞固然重要，但更重要的是稳固朝堂，儿臣以为……”朱标还未说完，朱元璋便大手一挥，打断了他：“标儿，你仁慈宽厚，朕知道。但这次，他们触碰了朕的底线！朕绝不姑息！”老朱听到藩王参与阴谋后，心中除了愤怒，还有对儿子的心疼、对藩王的失望。老朱一声令下，雷霆手段尽出。
参与阴谋的藩王被削藩禁足，刘御医被抄家问斩，相关党羽也都被一一清算。一时间，朝野震动，人人自危。那些原本与藩王暗中勾结的大臣们，此刻一个个吓得面如土色，纷纷上表撇清关系，生怕下一个就轮到自己。
朱标则在朝堂上据理力争，坚决支持朱元璋的决定，丝毫不给那些老油条们可乘之机。“诸位大人，难道你们要包庇谋害太子之人吗？难道你们要置大明江山于不顾吗？”朱标掷地有声，一番话怼得众人哑口无言。
这场风波过后，朱标在朝廷中的威望大幅提升。他不再是那个体弱多病的太子，而是一个睿智果决、敢于斗争的未来储君。
没有了刘御医的「神药」，朱标开始按照自己的方法调养身体。在调养身体期间，张公公精心照料他，饮食起居都安排得细致入微。他注重饮食均衡，坚持锻炼，并结合后世的一些养生知识，身体竟然一天天好转起来。原本蜡黄的脸色逐渐红润，消瘦的身形也渐渐丰盈。太医院的太医们都惊呆了，纷纷感叹太子殿下真是吉人天相。李太医更是激动得老泪纵横，他之前因为害怕刘御医的势力而不敢说出真相，如今看到太子康复，心中既愧疚又欣喜。