，从他们口中得知，袭击者是一群身着黑袍的神秘人，带着先进武器和诡异机械，目的似乎是寻找基地中一件古老的文物。
林晓意识到此事非同小可，立即将情况汇报给联盟总部，并决定顺着神秘人留下的线索追踪。线索指向一个遥远的废弃星系，据说那里曾是古代文明的遗迹，充满神秘能量。
小队抵达废弃星系后，发现这里被一层神秘的能量屏障笼罩。伊森远程协助分析，发现这层屏障蕴含古老而强大的能量，常规手段难以突破。玛雅凭借对古代文明符号的研究，在穿梭机的数据库中找到类似能量的记载，推测可能需要特定频率的能量波动才能打开屏障。
经过反复尝试，他们利用穿梭机的能量引擎调制出合适频率，成功突破屏障。进入星系后，一座巨大的古代遗迹出现在眼前，散发着幽邃光芒。遗迹周围布满各种防御机关，稍有不慎便会触发。
众人谨慎前行，破解了一道道机关。在遗迹核心区域，他们发现了一个巨大的能量水晶，正是神秘人想要寻找的目标。水晶表面刻满奇异符号，散发着强大而不稳定的能量。就在林晓等人准备研究水晶时，神秘组织的舰队突然出现，将遗迹团团包围。
神秘组织的首领现身，通过通讯频道冷笑道：“你们来得正好，这颗能量水晶是我们计划的关键，现在，它归我们了。”林晓毫不退缩，回应道：“你们的阴谋不会得逞，宇宙的和平不容破坏！”
战斗一触即发，神秘组织的战舰火力凶猛，发射出一道道致命的能量光束。艾瑞克驾驶战机升空，与敌方战机展开激烈空战；林晓带领队员依托遗迹防御，利用地形与敌人周旋；苏瑶则操作穿梭机的武器系统，支援地面战斗。玛雅在混乱中专注分析神秘组织的战舰弱点，通过通讯为队友提供精准打击建议。
在激烈战斗中，林晓发现神秘组织似乎在利用能量水晶的力量启动遗迹中的某种古老武器，一旦成功，后果不堪设想。他带领艾瑞克等人突破敌人防线，冲向能量水晶所在处。经过一番殊死搏斗，他们成功阻止神秘组织的行动，摧毁了启动装置。
神秘组织见计划败露，开始撤退。林晓等人也无心恋战，带着能量水晶返回地球联盟总部。经过研究，他们发现能量水晶蕴含着足以改变宇宙能量