在成功击退神秘生物后，科研城迅速展开了重建与反思工作。太子领导成立了专门的事故调查小组，深入剖析实验爆炸的原因，总结经验教训，确保类似的悲剧不再重演。同时，他鼓励科研人员们重振旗鼓，不要因这次挫折而气馁，强调每一次失败都是通向成功的必经之路。
科研人员们在太子的鼓舞下，重新投入到紧张的研究工作中。他们对水晶塔能量的研究更加谨慎，采用了多学科交叉的研究方法，结合物理学、能量学、符文解读等多个领域的知识，对之前的实验方案进行全面修正。各国也纷纷加大了对科研城的支持力度，提供了更多先进的实验设备和科研资源，助力物质传输技术的研究。
在重建科研设施的过程中，工人们在清理爆炸废墟时，意外发现了一块隐藏在地下的古老石板。石板上刻满了奇异的图案和文字，与之前在遗迹中发现的符文有着相似之处，但又存在一些独特的差异。科研人员立即对石板展开研究，经过艰苦的解读，他们发现石板上记载着关于遗迹建造者的部分历史以及一种古老的能量平衡方法。
据石板记载，遗迹建造者曾面临过与科研城类似的能量失控危机，他们通过一种特殊的能量调节装置成功解决了问题。这种装置能够精准地感知和调整能量波动，使其保持在稳定的状态。科研人员意识到，这一发现或许是解决当前困境的关键，能为物质传输技术的研究提供全新的思路。
与此同时，对神秘生物的研究也取得了重要进展。科研人员发现，这些神秘生物并非来自遗迹本身，而是被遗迹内不稳定的能量波动吸引而来。它们的身体结构和能量特性显示，它们可能来自宇宙的某个未知角落，适应于特殊的能量环境。通过对神秘生物的研究，科研人员对宇宙中不同能量形式的理解更加深入，这也为物质传输技术的能量控制提供了新的参考。
基于古老石板的启示和对神秘生物的研究成果，科研人员重新设计了物质传输实验方案。他们在新的实验设施中加入了模拟能量调节装置的功能模块，确保在实验过程中能够实时监测和调整能量波动。经过多次模拟测试和优化，新的实验方案逐渐趋于成熟。
在军事防御方面，为了应对可能再次出现的神秘生物威胁，科研城与各国军事力量合作，