在众人的努力与支持下，爱丽丝逐渐接受了自己作为克隆人军团长的特殊身份。她开始有条不紊地组织力量，对沙漠基地周围的丧尸展开清理行动。在大家齐心协力的奋战中，丧尸被逐渐消灭，基地周边的安全得到了有效保障。
苏木深知，要想彻底改变这个世界的格局，为吉尔等人创造更安全的未来，强大的力量是必不可少的。于是，他利用在沙漠基地获取的便利，为远在另一处基地的艾瑞斯博士提供了艾萨克博士的病毒研究资料。希望借助这些资料，能推动g病毒研究取得新的进展。
经过一段时间紧张而艰苦的研究，虽然更高级的g病毒并未成功研制出来，但艾瑞斯博士听从苏木的意见，成功研究出了弱化版的g病毒。对于t病毒，众人深知其缺陷。就目前情况而言，能达到完美状态并成功觉醒能力的，仅有爱丽丝一人。而像威斯克，虽然后期能力变得极为强大，但他需要不断吞噬人类来维持体内t病毒的稳定，已然走上了类似怪物般发展的歧途，这种方式显然不可取。
艾瑞斯博士带着5支弱化版g病毒来到了沙漠基地。据他介绍，弱化版g病毒保留了再生能力，并且能让人免疫t病毒感染，安琪拉已经率先使用并证实了效果。苏木经过深思熟虑，做出了这样的分配计划：给吉尔一支，卡洛斯和詹姆斯合一支，剩下两支他则小心翼翼地放进了系统空间。
吉尔、卡洛斯和詹姆斯在注射弱化版g病毒后，均顺利觉醒了再生能力，从此不再惧怕t病毒的感染。看着他们成功获得新的能力，苏木心中悬着的一块大石头终于落了地。他知道，在这个危机四伏的世界里，伙伴们又多了一份生存保障，自己也能更加放心地去推进后续的计划了。
苏木这段时间常常陷入两难的思索之中。一边是保护伞高层所藏的抗病毒素，它就像一把钥匙，能够彻底清理这个世界的丧尸，让世界重回安宁，恢复到往日的生机。可另一边，保留丧尸似乎也有着别样的考量。利用弱化版g病毒去笼络幸存者，让他们拥有抵抗丧尸的能力，进而发展出一批新人类，或许能在这片末世废墟上建立起一个全新的、更强大的人类文明。
这两个选择各有利弊，着实让苏木难以抉择。经过一番深思熟虑，苏木决定召开一个会议，让吉尔、爱丽