很快，时间来到了6月份。高迎祥带着起义军在河南四处折腾，将河南北部的彰德府、卫辉府搅得鸡飞狗跳。当地卫所的兵平时训练懈怠，粮饷还总被克扣，一个个饿得面黄肌瘦，身体素质差得很，手里的兵器破旧不堪，装备更是破败零散，根本没法好好打仗。面对起义军，一交手就被打得七零八落，完全抵挡不住。
就在这紧急时刻，副总兵陈永福临危受命，赶忙召集河南各地官兵。陈永福深知高迎祥的起义军打仗灵活狡猾，便精心谋划了一番，在彰德府林县设下了埋伏。等高迎祥的队伍一进入林县，陈永福一声令下，官兵们就从四面八方冲了出来。高迎祥毫无防备，被打得大败，只能带着残兵败将逃到山西陵川。
与此同时，在府谷县，李明这边新兵训练已经结束。李明经过深思熟虑，决定参考后世袁世凯北洋新军和解放军的编制，对部队进行整编，将全军整合为一个师。
这天，李明把众将都召集到营帐里。等人都到齐了，营帐内气氛严肃。李明缓缓站起身，清了清嗓子，端起茶杯喝了一口，神色凝重地说道：“诸位，如今这天下大乱，局势越来越严峻。高迎祥等义军四处攻城占地，各方势力混战不休。咱们要是想在这乱世里站稳脚跟，谋求发展，整顿和强化队伍那是刻不容缓。经过我多日思考权衡，决定对全军进行重新整编，采用一套新编制。这新编制参考了不少经验，相信能大大提升咱们队伍的战斗力。下面，我就给大家详细讲讲这新编制。”
“咱全军按新编制来。以前的小旗改成班，一个班10个人，设班长、副班长。三个班组成一个排，设一名排长。三个排编成一个连，设连长、副连长、司务长各一人。连部还要配备通讯员、军械员、文书，分别负责传递消息、保管武器、记录文档等事务。另外，每个连再设一个炊事班，专门负责全连的伙食。这样算下来，一个连大概100多人。
三个连编成一个营。营部设立一个营部排，里面有通信班和侦察班。每个营设营长、副营长，营部设司务长和一名营部参谋。
三个营组成一个团。除了这三个营，团里再设一个侦查骑兵连、一个卫生队和一个辎重营。团里有团长、副团长，再设一名参谋长，下面配备负责军械、后勤、制定作战计划等方面的