太平洋底的幽蓝荧光在潜水服外流转，秦明盯着手腕的生物信号器，指针正疯狂逆时针旋转——这是“母性代码”与深海生物膜共振的警示。他握紧手中的基因密钥，那是用弟弟培育的蒲公英基因改良的抗毒载体，在潜水灯的照射下，密钥表面的齿轮缺口处，竟生长出细小的绒毛状结构。
“前方500米，环形建筑能量反应增强。”林涛的声音从水面指挥船传来，信号因海水压力而失真，“生物膜正在修复建筑外壳，那些发光的齿轮，其实是基因级的机械共生体。”秦明点头，透过潜水镜，他看见建筑表面的荧光纹路正组成巨大的双螺旋，每个碱基对都嵌着微型齿轮，缺口处不断吸入海水，吐出冰蓝色的毒砂结晶。
001号少年的潜水服突然传来蜂鸣，他指着建筑顶端的发光体：“秦大哥，那里有心跳声，和陈爷爷的老式座钟一样……”少年的瞳孔此刻呈现出与生物膜相同的荧光蓝，却在接触密钥绒毛时，闪过一丝属于人类的琥珀色。秦明突然想起母亲日志里的话：“真正的密钥不在基因里，在愿意为他人停下齿轮的勇气中。”
建筑入口的齿轮闸门自动开启，内部空间被液态基因溶液填满，上千个透明茧袋悬浮其中，每个茧袋里都蜷缩着半人半鱼的胚胎，他们手腕的齿轮纹身缺口方向，正与全球七名浮尸的坐标一一对应。大宝的声纹从水面传来：“胚胎的线粒体dna与陈家村幸存者完全一致，他们在批量复制抗毒基因！”
控制台前，那个曾在海底出现的半透明人影突然转身，他的胸口嵌着枚发光的齿轮核心，正是秦文远警徽的变形体。“欢迎来到方舟2号，0912。”他的声音像齿轮摩擦般刺耳，“你父亲当年炸毁北极实验室时，特意留下了000号胚胎——也就是我，初代完美实验体。”
秦明的基因密钥突然发烫，他认出对方胸口的齿轮核心，正是母亲从他基因中剥离的“缺陷片段”：“你不是完美体，你是被父亲故意植入缺陷的诱饵。”对方大笑，茧袋中的胚胎同步发出机械蜂鸣：“没错！但这个缺陷，让我看懂了人类最致命的弱点——怜悯。你以为救下陈家村少年，就能阻止齿轮闭合？他的基因正在与生物膜融合，很快就会成为方舟2号的活体开关。”
少年突然抱住头部，潜水服