。后来吴三桂也投降了鞑清，至此大部分的关宁骑兵都变成了八旗军队，受鞑清的指挥进入关内，与李自成和南明军队作战。
虽然打清兵不行，但剃发降清以后，关宁骑兵打打南明、打李自成，却是所向披靡，战斗力爆表，为满清入主中国立下了汗马功劳。
究其原因，关宁铁骑说到底还是从李成梁的辽东骑兵脱胎而来的，为了从朝廷套取军饷，李成梁养寇自重，这支骑兵相较于其他明军将领的私兵，其“私有化”的程度更高，而最糟糕的是，他们不像戚家军那样，一直把自己当成一支“国家军队”，而是只把从军当做升官发财的捷径。
相比于当时大明的其他军队，辽东骑兵拥有种种特权，诸如发双饷、拥有战利品的分配权、拥有军屯的股份，甚至还有很多的各种各样的福利以及丰厚的安家费，乃至于伤残转业退伍费之类的东西。
如此一来，辽东骑兵已经在事实上成了自负盈亏的军事集团。
努尔哈赤的八旗制度上也是脱胎于辽东铁骑，因此“关宁铁骑”和“八旗骑兵”本质上都是同源于辽东铁骑，所不同的就是两者的阵营不同而已，最根本的本质，都是自负盈亏的军事集团。
然而，关宁铁骑相对于八旗骑兵，其惰性远高于后者。因为关宁铁骑他还有一个重要的收入来源，那就是大明朝廷给予的军饷，而八旗军没有，一切都得靠自己抢。
这样一下就能看出高低强弱了，穷人的孩子早当家嘛，人家一切靠自己抢，你坐在城里就有朝廷发钱，你说谁的战斗意志更强，谁更愿意拼了命打胜仗？
虽然袁崇焕的战略、战术都是一塌糊涂，但他活着的时候至少关宁铁骑从表面上来看还是“听招呼”的，然而自从袁崇焕死后，祖大寿基本上就处于听调不听宣的状态，事实上成为了独立于明朝军事体制之外的一个独立武装。
影响到关宁铁骑利益的时候，祖大寿就跟明朝一致对后金，显得特别爱国。但是为了保住自己的实力，他也可以宣布投降后金。
明末随着大明朝廷经济的进一步崩溃，朝廷已经越来越难发出军饷了，李自成打进北京的时候，吴三桂的关宁铁骑已经快一年时间没有领到军饷了，这个时候还指望一支自负盈亏的军事集团对朝廷存在多少忠