最初的护庭十三队是由山本元柳斎重国创立的一个杀手组织，后来被五大贵族收编以后替零番队守护静灵庭、尸魂界与现世的秩序。
《死神》剧情前110年，以五番队队长·平子真子为首的8名死神正、副队长先是受到九番队五席·东仙要的偷袭、然后被五番队副队长·蓝染用作死神虚化的材料——
虽然虚化的过程被十二番队队长·浦原喜助阻止，但已经感染虚毒的平子真子几人只能在二番队队长·四枫院夜一的帮助下逃至现世，从此如同过街老鼠一般在空座町躲躲藏藏……
而护庭十三番队遭受史上从未如此严重的“渎职叛变”事件后，番队队长、副队长职务大量空缺：
二番队队长四枫院夜一叛逃，队长职务空缺，暂时由副队长大前田希之进代管；
三番队队长凤桥楼十郎叛变，队长职务空缺，暂时由副队长射场千铁代管；
五番队队长平子真子叛变，队长职务空缺。暂时由副队长蓝染惣右介代管；
七番队队长爱川罗武叛变，队长职务空缺。暂时由副队长小椿刃右卫门代管；
八番队副队长矢眮丸莉莎叛变，副队长职务空缺；
九番队队长六车拳西、副队长久南白叛变，队长、副队长职务空缺，暂时由八番队队长京乐春水兼管；
十番队队长志波一雄殉职，队长职务空缺，副队长空缺，暂时由十三番队队长浮竹十四郎兼管；
十一番队队长鬼严城剑八重伤不治、副队长野尻太郎战死，队长、副队长职务空缺，新晋队长更木剑八接受队首培训中；
十二番队队长兼技术开发局局长·浦原喜助叛逃、副队长猿柿日世里叛变，队长、副队长职务空缺，暂时由技术开发局副局长涅茧利代管；
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但是，经过50多年的筛选与淘汰后，护庭十三番队对编制重新做出调整，并吸纳了许多新鲜血液：
一番队兼总队长从护庭十三番队创建以来就是山本元柳斎重国担任队长，其他人想都别想……而副队长仍是雀部长次郎；
二番队队长兼隐秘机动军团司令由碎蜂担任，她是出自尸魂界四大贵族之一四枫院家的亲随。副队长依然是大前田希之进；